《暗殺教室第二季》

經過南國小島上和鷹岡的決鬥，3年E班的各位與殺老師（福山潤配音）的關係進一步拉近。

雖然暗殺活動仍在繼續，然而這似乎已經變成了師生之間互動玩樂的重要環節。

以茅野楓（洲崎綾配音）為代表的學生們又開始策劃更加精彩的暗殺陷阱。

除此之外，他們幫助比琪老師（伊藤靜配音）追求烏間惟臣（杉田智和配音），又或者磨刀霍霍與A班的精英們展開榮譽與尊嚴之戰。

與此同時，白先生帶領堀部系成（緒方惠美配音）捲土重來，而神秘的死神則將E班推向各位兇險的境地。

隨著最後期限一天天逼近，殺老師和學生們的關係變得愈加微妙。

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2016-01-07

第1話夏日祭典的時間

在南國小島上舉行暗殺修行的3年E班的學生在取得與鷹岡的戰鬥的勝利後，舉辦了男女配對的試膽大會，並幫助伊莉娜老師追求烏間老師。暑假也要結束了，E班的學生一起和殺老師去了夏日祭典。
2016-01-14

第2話楓的時間

因為全國的雞蛋供大於求無法出貨，茅野提出了布丁暗殺計劃、同時可兼顧解決大量雞蛋被廢棄的問題。E班的同學合力製作了超大補丁實施了計劃。烏間老師對E班學生進行了山中跑酷暗殺版警察抓小偷的訓練，學生們使用各種方法逃脫烏間老師和殺老師的抓捕。除此之外，新聞中出現的內衣小偷事件也令人擔憂。
2016-01-21

第3話堀部糸成的時間

被學生懷疑是內衣小偷的殺老師為了證明自己的親白，親自去抓捕真正的小偷，並因此和堀部糸成展開了戰鬥。最終戰敗的堀部糸成被無情拋棄，並持續暴走。在3年E班同學的鼓勵下，堀部糸成道出了自己的過去、解開了心結、磨去了觸手、真正融入了班級。
2016-01-28

第4話紡織的時間

堀部糸成利用自己的特長，想到了操縱遙控玩具車襲擊殺老師要害的暗殺計劃，並揹著女生和班裡的男生展開了神秘的計劃。因為木村對自己的本命很是介意，E班的每個同學開始互起奇怪的稱號。
2016-02-04

第5話領導者的時間

E班的委員長磯貝悠馬為了維持家人的生計，違反校規在餐廳打工，不幸被A班的五英傑發現。A班班長淺野學秀提出了在體育節和E班競賽、如果E班取得勝利則守住秘密的條件，E班同學竭盡全力和理念截然不同的A班比拼。
2016-02-11

第6話 Before After的時間

在期中考試前的2周，對於自身暗殺技術過於自信的E班學生，不行弄傷了幼稚園年邁的園長。自此，學生們放下期中考試的準備，代替園長管理幼兒園，將幼兒園修繕得耳目一新、並取得了孩子們的喜愛。
2016-02-18

第7話死神的時間前篇

伊莉娜老師的生日到了，E班的學生們買了花束，想盡辦法讓伊莉娜老師所喜歡的烏間老師送花作為禮物，不料卻被伊莉娜老師識破。至此之後，伊莉娜再沒有出現在學校，令E班的同學很是擔憂。此時，自稱“死神”的殺手出現，學生們前往解救伊莉娜老師。
2016-02-25

第8話死神的時間後篇

對於自稱“死神”的殺手，E班的同學毫無辦法。此時，烏間老師和殺老師趕到。烏間和“死神”展開了一對一對決，解救了E班的同學。
2016-03-03

第9話 2周目的時間

到了臨近畢業商討今後出路的時候了，E班的同學大多有了打算，但潮田渚卻始終不知道自己適合做什麼。此時，渚的母親卻強迫潮田渚按照她的想法去走今後的路，在殺老師的幫助下，潮田渚反抗了母親，讓母親意識到孩子的想法也是重要的。
2016-03-10

第10話學園祭的時間

學校的學園祭到了，為了比拼銷售額，A班的同學拉攏了贊助商舉辦了豪華的活動，E班的同學則自給自足、利用地處山林的自然環境、靠新鮮的食材吸引了顧客。
2016-03-17

第11話期末的時間第2課時

期末考試要到了，因為理念和父親不同，A班的班長淺野學秀放下面子請求E班的同學在期末考試中贏得勝利，E班的同學接受了這個請求。
2016-03-24

第12話空間的時間

E班和A班的期末考試對決終於到了最後的時刻，特別是難度超大的數學測試，最後一題尤為不易，是屬於淺野學秀和赤羽業之間的對決。在互相和難題搏鬥的過程中，赤羽業想到了曾經在E班的經歷，順利解答了問題。隨著E班在期末考中的大勝，淺野學峰再次對E班進行了刁難。
2016-03-31

第13話培養的時間

期末考試後，淺野學峰以解僱脅迫殺老師參與不公正的比試，殺老師成功贏得了勝利、證明了自己的教育理念。三年E班決定在話劇發表會上演出《桃太郎》。
2016-04-07

第14話真面目的時間

當 E 班在戲劇節之後清理的時候，他們發現他們的一個同學隱藏了一個和殺老師過去有關的天大秘密。
2016-04-21

第15話告白的時間

在經歷了一次緊張而可怕的遭遇之後，殺老師開始坦白他的真實身份。
2016-04-28

第16話過去的時間

在殺老師揭露了他過去的行為和身份之後，E級陷入了困境，這些資訊可能會影響他們的暗殺計劃。
2016-05-05

第17話分裂的時間

由於這個班級在是殺死小路老師還是試圖拯救他問題上分裂成兩派，殺老師自己提出了一種解決問題的方法。
2016-05-12

第18話結果的時間

殺老師的命運歸結為一場老朋友渚和業之間的戰鬥。
2016-05-19

第19話宇宙的時間

渚與業這次挑戰的是“劫持太空站”這個超乎常識的任務。他們能否平安地得到能拯救殺老師的研究資料……？
2016-05-26

第20話情人節的時間

隨著高中入學考試的臨近，渚不確定他的未來應該走哪條路。3-E 班用大量的巧克力迎接情人節。
2016-06-02

第21話信賴的時間

殺老師還有一個專案計劃用他心愛的 E 級課程結束這一年，但是政府自己的計劃可能會成為障礙。
2016-06-09

第22話生日快樂的時間

學生們爭先恐後地想見老師最後一面。殺老師過去的一個人物帶著對這個超級生物的深仇大恨來到了這裡。
2016-06-16

第23話最終Boss的時間

兩個超級生物之間的激戰威脅到了3-E 班的學生。殺老師能在保護他們的同時保護自己的生命嗎？
2016-06-23

第24話畢業的時間

時間不多了，E 班的學生們必須一勞永逸地決定是否要殺死這位在過去一年裡改變了他們生活的老師。
2016-06-30

第25話未來的時間

畢業日: 人生的一個篇章結束了，另一個篇章開始了，3-E 班的學生和老師們繼續在這個世界上開闢他們自己的道路。