《蔚藍檔案 The Animation》

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第1話 阿拜多斯高等學院 停辦對策委員會

全校僅有5名學生。 被沙漠包圍的阿拜多斯高中正面臨著廢校的危機。 為了擺脫這個情況，隸屬「對策委員會」的5名學生每天都過著忙碌的生活。 有一天，白子遇見了一位大人。 他是從聯邦學生會被派遣過來的老師。

第2話 私は認めない！

與老師相遇之後，對策委員會的所有成員終於有了阻止學校廢校的希望。 在擊退了步步緊逼的頭盔團之後，這個念頭也逐漸開始膨脹。 然而，身為對策委員會成員之一的茜香卻沒辦法認可老師。 這時，她突然陷入了危機之中......！？

第3話 請交給便利屋68吧！

即便眼前的問題得到了解決，對策委員會和老師仍然還是對龐大的債務嘆息不已。 想不出解決方案的一行人進入了拉麵店，並與一群自稱亡命之徒的「便利屋68」的女孩一拍即合。 然而第二天，“便利屋68”卻突然開始襲擊阿拜多斯高中......！？

第4話 蒙面泳裝團☆

阿拜多斯對策委員會前往有名的法外之地「黑市」，追尋此前襲擊阿拜多斯頭盔團的線索。在和偶然遇見的崔尼蒂學院的女孩「日富美」一同調查的途中發現，償還的錢存在流入地下錢莊的可能性。 就在此時白子突然說道「我要去搶劫銀行」……！ ？

第5話 才不是什麼朋友！

襲擊阿拜多斯失敗後，便利屋68選擇推進下一個計劃。作為社長兼領導者的亞瑠，正在與自己所描繪的理想相去甚遠的現實中掙扎。與此同時，離開黑市的白子等人決定放棄她們意外獲得的鉅款。此時，茜香打工的地方「柴關拉麵」突然發生了一件很可怕的事。

第6話 歌赫娜風紀委員會

出現在白子等人面前的是格黑娜學園的風紀委員會。她們的目的是逮捕她們學校的問題兒——便利屋68。儘管她們提出由她們來處置便利屋68的要求，對策委員會仍拒絕了她們的提議，因為她們沒辦法將炸燬柴關拉麵的便利屋68拱手相讓。面對態度強硬的風紀委員會，對策委員會和便利屋68所採取的行動究竟是……

第7話 唯有前進……

結束與風紀委員會的戰鬥，並且與便利屋68告別之後，阿拜多斯終於迴歸了日常生活。 在這種情況下，前往拜訪因爆炸而受傷的柴關拉麵店長的對策委員會少女們，得知了一個令人震驚的事實。 另一方面，星野露出了不同以往的一面，並且似乎在思考些什麼。 她在心中反覆思考的事情，究竟是......

第8話 秘密

在星野的提議下，對策委員會的各位與老師決定去水族館遊玩。她們度過了一段宛如之前戰鬥日常是虛幻的寧靜時光。和各位一樣，星野也在享受著這段時光，但白子卻感到了一絲異樣。她下定決心採取行動……

第9話 前往阿拜多斯沙漠

當對策委員會得知，阿拜多斯的土地歸屬權並不屬於阿拜多斯學校，而是在凱撒集團手裡，他們究竟在謀劃什麼。為了查明原因，白子等人前往阿比多斯沙漠，在那裡等待她們的是……

第10話 唯一有意義的地方

星野留下的信中，記載著她的過去和思緒。 正當白子要去追星野時，凱薩公司襲擊了阿拜多斯高中。 對策委員會在突如其來的攻擊下陷入困境，這時她們突然出現在他們的面前。

第11話 私の生徒だから

戰鬥結束後，為了拯救星野，老師決定獨自去找黑服，黑服伸出手問老師“是否願意與我們合作”。但老師並不同意黑服的合作，對策委員會與凱撒的最終決戰將一觸即發……

第12話 我回來了

做好萬全的準備後，阿拜多斯對策委員會和老師抵達了沙漠。 另一方面，在被俘虜的星野的腦海中，有一個想法時隱時現。 為了她們的學校和未來，最後的戰鬥即將分出勝負。