《迷糊女戰士》

名為”阿克羅斯“的理想推進組織（恐怖組織）將佔領F市（疑似為福岡市）作為征服這個腐朽的世界的第一步。該組織的主要成員優秀（Excel）願意無條件完成組織首領易路扒左的任何任務，但是她元氣而無腦的特徵給任務的成功造成了很大的障礙。

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1999-10-07

第1話六道神士殺害計畫!!

F県F市の地下深く本部を構える秘密結社アクロス。それは、世界征服の第一歩として市街征服を企む理想推進機関である。しかし、構成員は美形の総帥イルパラッツォとお元気お馬鹿な美少女エクセルの二名だけという情けなさ。本日も「社会に害毒を垂れ流す漫画家を抹殺せよ」という小さい仕事にいそしむエクセルだが…。
1997-10-14

第2話來自火星的女人

指令碼：黒田洋介 / 分鏡：安蒜晃士 / 演出：福多潤 / 作畫監督：敷島博英
1997-10-21

第3話地獄大逃脫

アクロスに現れた美貌の新構成員ハイアット。しかし彼女はすぐに血を吐いて絶命する、筋金入りの虚弱体質だった。イルパラッツォはハイアットに、行方不明となったエクセルの捜索を命ずる。一方、当のエクセルは、なぜか密林地帯で傭兵部隊に捕われ、地下牢に入れられていた…。
1997-10-28

第4話愛喲

例によって道ばたで行き倒れていたハイアット。彼女を助けたのは、同じアパートの隣室に住む渡辺だった。一目でハイアットに恋してしまった渡辺は、なりゆきで彼女とデートすることになるが、たまたまその場に居合わせた同僚の岩田と住吉に後をつけられ…。
1997-11-04

第5話おもしろい巨塔

指令碼：倉田英之 / 分鏡：山川吉樹 / 演出：村田雅彥 / 作畫監督：柳瀬雄之
1999-11-11

第6話寒が冬いぜ!!〜遭難編〜

指令碼：黒田洋介 / 分鏡：殿勝秀樹 / 演出：西山明樹彥 / 作畫監督：大木良一
1999-11-18

第7話地下道のメロディ

指令碼：倉田英之 / 分鏡：福多潤 / 演出：福多潤、平池芳正 / 作畫監督：藤原潤
1999-11-25

第8話視聴率強化週間

活動資金も底をつき、連日の猛暑と空腹にさいなまされるエクセル。危機を救ったのは近所に住む薄幸の美少女コゼットだった。エクセルたちは美女っ子新聞の勧誘員からゲットしたプール券で、美女まみれの市民プールに出かけることにするが…。全編画面に美女しか登場しない？珠玉の一編！
1999-12-02

第9話ボウリング娘。

市街征服の第一歩として、若者たちに人気のあるスポーツを調査するためボウリング場でバイトすることになったエクセル＆ハイアット。その日は「ボウリング娘。」というテレビ番組の撮影が行われていたが、そこに謎の武装集団が乱入し、エクセルは彼らと一戦交えるはめに…。
1999-12-09

第10話メンチの大冒険

指令碼：黒田洋介 / 分鏡：殿勝秀樹 / 演出：粟井重紀 / 作畫監督：柳瀬雄之
1999-12-16

第11話ひっこめ!青春!

指令碼：倉田英之 / 分鏡：井之川慎太郎 / 演出：西山明樹彥 / 作畫監督：大木良一
1999-12-23

第12話大市街partII

指令碼：黒田洋介 / 分鏡：福多潤 / 演出：福多潤、平池芳正 / 作畫監督：谷口守泰
2000-01-06

第13話新春年忘れかくし芸大會

年末年始恒例、年忘れ新春特番すぺさる！というわけで、エクセルとハイアットが東西両軍に別れて繰り広げる、お宝っぽいけどどこかで見たような隠し芸の数々！もちろん豪華ゲストとは名ばかりのおなじみメンバーも総出演！行く年来る年あけおめことよろ、極楽悦楽恐悦至極の30分！
2000-01-13

第14話テコイレ

人手不足の市街安全保障局に、新たな女性メンバー・六本松が配属される。人間離れした彼女の能力に不審を抱く松屋たちだが、岩田だけはおかまいなしに六本松にモーションをかけまくる有様。一方、エクセルはイルパラッツォの命を受け、ヤバゲな箱を抱えて作戦行動にいそしんでいた…。
2000-01-20

第15話もっと! てこいれメモリアル

指令碼：倉田英之 / 分鏡：八谷賢一 / 演出：粟井重紀 / 作畫監督：柳瀬雄之
2000-01-27

第16話 AIをとりもどせ!

指令碼：黒田洋介 / 分鏡：殿勝秀樹 / 演出：西山明樹彥 / 作畫監督：大木良一
2000-02-03

第17話アニメーションUSA

指令碼：倉田英之 / 分鏡：別所誠人 / 演出：平池芳正、福多潤 / 作畫監督：飯飼一幸、谷口守泰
2000-02-10

第18話市立戦隊ダイテンジン

市街の状況を憂えるF県F市の為政者たち。蒲腐はかねてから準備していた戦闘服を無理やり岩田たちに着せると、市立戦隊ダイテンジンとして出動させるのだが…。「エクセル◇サーガ」の原点となった幻のコミック「ダイテンジン」が、いまこの実験アニメで蘇る？（※◇はハートマーク）
2000-02-17

第19話メンチの大冒険2〜80時間世界一週〜

またまたふとしたことからアパート脱出に成功したメンチは、大富豪のお嬢様・アン安西に拾われる、アンは遺産相続を賭けた「80時間世界一周」の記録に挑戦している最中であった。なりゆきでアンと行動をともにすることになったメンチ。しかし、アンの行動を阻もうとする刺客が、二人のもとに迫っていた…。
2000-02-24

第20話よりぬきペドロさん

第1話にその場限りの脇役として登場、非業の最期を遂げたかと思いきや、霊として奇跡の復活（？）を果たし、いつのまにやら本編とはまったく関係なしに独自のストーリーを展開するに至った外国人季節労働者・ペドロ。愛を求めてさすらう魂の彷徨い人の行く手に待つものは何なのか？行け行けペドロ、それなりに。
2000-03-02

第21話美濡歩（ビジュアル）K

指令碼：倉田英之 / 分鏡：山口頼房 / 演出：井之川慎太郎 / 作畫監督：柳瀬雄之
2000-03-09

第22話侵略、おふくろ様

指令碼：黒田洋介 / 分鏡：井之川慎太郎 / 演出：福多潤、平池芳正 / 作畫監督：飯飼一幸
2000-03-16

第23話世紀末征服者伝説

指令碼：倉田英之 / 分鏡：福多潤 / 演出：紅優 / 作畫監督：大木良一
2000-03-23

第24話きみのためなら死ねる

イルパラッツォの銃弾を受けて荒野に倒れたエクセルを救ったのは、市街安全保障局のメンバーだった。街をアクロスが恐怖に陥れる中、彼らは秘密のアジトで反撃の機会を伺っていたのだ。彼らのおかげでエクセルは意識を取り戻すが、記憶を失っていることに気づく…。
2000-03-30

第25話やりにげ

激しい攻防戦の中、アクロス移動要塞に侵入を果たす市街安全保障局。一方、戦闘のどさくさにまぎれて要塞内に潜入したエクセルは、失った記憶に導かれるかのように、イルパラッツォの鎮座する玉座の間へと知らず知らず導かれていくのだった…。
第26話やりすぎ

放送開始から終了に至るまで、なにかと物議をかもした世紀末へっぽこ実験アニメ「エクセル・サーガ」。TV放送という規制の枠を取り払い、地上波放送ではご法度のあんなことやらこんなことやら無節操に大胆に詰め込んだ特別番外編！制作当時、イベント会場で限定上映されファンの喝采を浴びた、正真正銘の完結編！