《最終兵器少女》

最終兵器彼女於北海道的某個高職裡，千瀨（ちせ）和修次（しゅじ）如一般情侶的交往著．某天，突來的札榥空襲事件，讓修次發現到千瀨身為殺人兵器的秘密，她和修次要如何發展呢？

而這個北海道的小鎮、這個宇宙中小小的藍色星球的未來又是如何呢？

她和他，將譜出這個小小星球上的最後一首情歌……第1話我們將繼續相戀第2話我正在成長第3話兩個人第4話冬美學姊第5話謊言第6話同學第7話想要保護的東西第8話大家都在改變第9話明美第10話 …然後第11話兩人的時光第12話 LOVE SONG第13話然後，我們將繼續相戀最終兵器彼女Another love song (OVA)戰鬥機盤旋於博多空中，伴隨轟炸機投落的巨大聲響，福岡巨蛋周圍已陷入一片火海。

此時，在天空中突然出現一道神秘光芒...而它是繼千瀨之後出現的另一台終極武器。

另一方面，無情的任務以及內心的煎熬，被迫改造成為武器的千瀨也成為軍方所仰賴的力量，即使如此，心中仍無時不刻都想著修次。

另一台終極武器對於千瀨來說，究竟是敵是友？

就在如此絕望的戰況中，再度響起了悲傷的love song—。

這是與電視版在同一時間軸上進行的全新故事。

千瀨究竟在戰場上看到了什麼？

她究竟在想些什麼？

這些真相將首次呈現在大家的面前。

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第1話ぼくたちは、戀していく

修次與千瀨是住在北海道鄉下的高三學生，自從內向的千瀨鼓起勇氣向修次表白後，兩人便開始交往。老是喜歡說“對不起”的千瀨是個膽小又迷糊的女孩。而修次每次看到她這種笨拙模樣總會不自主地發怒，但事後卻又感到後因悔；在互相交換日記後的一次約會里，兩人終於第一次對彼此有了真正的認識。某日，不明國籍的敵人突然對札幌展開空襲，滿天都是敵機與如雨般落下的炸彈，當修次正打算逃難時，卻發現空中忽然出現一個疾速飛行的神秘物體，該物體擊落無數敵機後墜落在修次的面前；就在煙霧散去的那一刻，修次簡直不敢相信自己眼睛，眼前這個身上長著翅膀及巨大武器的人竟然就是千瀨……
第2話私、成長してる・・

札幌遭空襲後已經過一個禮拜，大家也恢復了正常的作息。在傾聽千瀨訴說了她被改造成終極武器的事情後，修次雖然一直無法接受這項事實，但也只能在一旁默默看著千瀨出發執行任務。晚上，看完千瀨的交換日記後，修次再也壓抑不住心中的激動與悲痛，立刻衝出家門尋找千瀨……
第3話ふたりで

在逃脫軍方的監視後，修次與千瀨來到了展望臺。兩人商量過後，決定要逃到一個沒有人認識的地方去，然而當千瀨回家備妥行李時，川原等軍方人員卻出現在她的面前；就這樣，修次就一個人在車站等待著千瀨，直到天亮……一個熟悉的身影再度映入眼簾……“冬美學姐……”在修次心中那段苦澀的初戀又再次喚醒他的記憶……
第4話ふゆみ先輩

難得能有一個休假，千瀨與修次來到水族館享受了一段短暫的甜蜜約會，沒想到川原卻又在此時出現在兩人面前，修次為此十分憤怒，但千瀨卻制止了他並帶著悲傷的笑容離去；當晚，修次再次來到了冬美所住的公寓前……“恐怖的象徵”，這就是在戰場上的千瀨，為此而感到痛苦的千瀨，在前線認識了良平、中村以及冬美的丈夫阿鐵。
第5話うそつき

化為“武器”並將城鎮一個個毀滅的千瀨，對於自己越來越感到厭惡。某日，當大家在上課時突然發生了大地震，由於千瀨還無法完全控制自己的力量，因而在感應到地震時便發動了攻擊，毀掉了校舍的一部份。親眼目睹此景的修次，開始對千瀨感到畏懼；修次在將千瀨交回軍方之後，對於一直很擔心的明美與阿淳卻無法作任何說明……
第6話クラスメイト

修次與千瀨在展望臺上再次相遇。修次下定了決心，把關於自己跟冬美學姐的事告訴千瀨，但是千瀨卻激動地拒絕而不肯聽；修次依然執意繼續講著，此時千瀨卻提出了“恢復成為同學關係”的要求。從此，兩人在學校的關係變得十分尷尬，不知道該如何面對彼此。某日，在戰場上暫時休息的千瀨，突然想起了與修次一起渡過的那段時光，忍不住開始哭泣……
第7話守りたいもの

千瀨又再度擊退大舉來襲的敵軍，平安地渡過了危機。對於自己一直無法去理解身為“武器”的千瀨以及這場戰爭，修次感到生氣與愧疚；就在這時候，修次巧遇獨自在公園裡徘徊的千瀨，於是答應要再跟她去一次水族館……另一方面，進入軍隊服役的阿淳，至今仍然不清楚其他士兵口中所說的“千瀨”這個名詞，究竟是什麼意思……
第8話みんな変わっていく

在戰況持續膠著的戰場上，千瀨又再次遇到了阿鐵，並在阿鐵秘密的住處得到片刻的休憩。一架敵機墜落在山裡，街上聚集了許多準備上山搜捕敵軍飛行員的民眾，而由佳利自從失去阿竹之後整個人就變了一個樣，此刻的她心中滿懷著恨，也加入了搜捕的行列。修次試著跟明美談論關於阿淳上戰場的事……而就在這天，鎮上發生了一場大地震，原本看似和平的景象也改變了……
第9話アケミ

在結束了與阿鐵共渡兩天的逃避現實之旅後，千瀨又回到部隊重新面對現實，但卻因為身體疏於維修而不支倒地，醫生們在診療過後都認為千瀨不會再醒過來了。遭大地震肆虐過後的鎮上幾乎陷入徹底的毀滅，此時明美的妹妹突然出現在修次面前，並哀求修次去見明美一面。至此，修次才知道原來明美已身負重傷，而明美也在臨終前第一次向修次告白……
第10話 …そして

千瀨為了終結這場毫無意義的戰爭，因此又出手毀滅了一座城市，而在這一陣巨大爆炸閃光中死命逃竄計程車兵群裡，竟然也看到阿淳的身影……由於學校就要被軍隊接收了，於是大家決定要辦一個送別會；在這個看似忙碌的一天當中，修次從川原口中得知千瀨不可避免的命運，他也毅然決然的結束了與冬美學姐這一段曖昧的關係。在這一切都結束後的清晨，千瀨終於出現在修次的面前……於是他們兩個決定……“私奔”！
第11話 2人だけの刻(とき)

放眼盡是寒冷荒涼的冬季大地，千瀨與修次來到了一個不知名的港灣城鎮，悄悄地開始過起了兩人同居的生活。他們兩人拋棄了一切，棲身在一棟半毀的公寓裡享受著幸福的時光；然而，千瀨卻也因此無法接受維修，身體開始遭到急速的侵蝕。此時，川原又出現在千瀨與修次的面前；面對著川原，修次做出了一項重大的決定……
第12話ラブ・ソング

身處這個遭到徹底破壞而化為瓦礫的港灣城鎮，修次在公寓裡照顧著幾乎無法動彈的千瀨。當千瀨喝下最後一瓶藥的那天夜晚，千瀨的身體產生了激烈的變化並遭到機械的侵蝕。修次隱約感覺到世界即將迎接毀滅，為了拯救千瀨的性命，於是把她交給了軍方，並對犯下大錯的自己感到無限的自責。此時，一個人留在房間裡的修次，恰巧發現了千瀨的日記……
第13話そして、ぼくたちは戀していく

展望臺，那是修次與千瀨的約定之地。在不斷尋求著彼此溫暖的夜晚結束後，修次與千瀨開始聊了起來，千瀨用著彷彿像是在讚頌過往犧牲者的口吻，訴說著這個星球的歷史，並告訴修次這個星球的末日即將到來。這時候，天空出現了成群的敵軍戰機，千瀨在答應修次“會保護這個城鎮到最後”之後，便朝天空飛去。地球即將迎接最後一刻，而修次也在地面守護著千瀨……