フィクションの忍者に憧れる天涯孤独の少年・らっぱは、雪の降る夜に屋上から転落し、本物の忍者・御徒町(おかちまち)と師匠に命を救われる。
弟子入りを願って押しかけ、三人は家族のように暮らし始めた。
数年後、らっぱは町を守る忍者を目指して元気に奔走。
師匠が開いた駄菓子屋にはらっぱを慕う子どもたちが集まり、家族や仲間と笑い合える居場所となっていた。
この日常がずっと続くと信じていたらっぱだが、御徒町に介抱される師匠を目にし、引退した師匠が隠してきた苦しみを垣間見る……。