《攻殼機動隊ARISE border:1 Ghost Pain》

第四次非核大戰一年後的2027 年，在還留有戰爭痕跡的新濱市，發生一起疑似收賄的軍人遭到槍殺的案件。

雨幕中，公安‧荒卷大輔為了找尋軍人的電子腦而潛入墓地，卻遭到想證明上司清白的草薙素子持槍抵住身後。

但是，追查這起案件的並非只有草薙一人，擁有「不眠之眼」的巴特懷疑她就是爆破殺傷事件的犯人，因而緊咬著不放；以及正持續追查槍擊案與娼妓命案間共通點的新濱縣的刑警‧德古沙。

此外，「501 機關」的徠津中佐也正注視著草薙的行動。

為了尋找自身的未來與理想，草薙的本能將自此覺醒（ARISE）……。